| 學生 | 指導老師 | 碩/博士 | 學年度 | 論文題目 | 備註 |
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| 黃秉榮 | 李文献/李冠卿 | 碩士 | 091 | Nanometric characteristics of fault gouge on the Chi-Chi earthquake, Taiwan(921斷層泥中奈米礦物微粒的探尋與滑動時地層溫度標定) | 畢業論文 |
| 張仕林 | 聶斯特 | 碩士 | 091 | Geometric Algebra and Clifforms: with Application to the Gravitational Hamiltonian and Quasilocal Quantities(幾何代數與Clifforms之轉換及其於重力哈密頓函數與準局域量之應用) | 畢業論文 |
| 邱介宏 | 李弘謙 | 碩士 | 091 | Identification for DNA sequences based on all sorts algorithms and search of ORF(各類演算法對DNA序列的辨讀與ORF之搜尋) | 畢業論文 |
| 謝立青 | 李弘謙 | 博士 | 091 | Universal Lengths of Bacterial Genomes and Model for Genome Growth(細菌基因體的普適長度與基因體生長模型) | 畢業論文 |
| 邱智瑞 | 李弘謙 | 碩士 | 091 | 以個人電腦叢集平行運算模擬蛋白質結構 | 畢業論文 |
| 劉君豪 | 吳心恆 | 碩士 | 091 | ferroelectric and antiferroelecytric liquid crystal mixer in improvment research of TN LCD response time(鐵電與反鐵電液晶添加劑於扭旋型液晶光電顯示元件響應時間之改進研究) | 畢業論文 |
| 魏建豪 | 賴山強 | 碩士 | 091 | Statistical mechanical study of the energy and enthalpy distribution functions of some physical systems(物理系統之能量與焓分佈之統計力學研究) | 畢業論文 |
| 陳鴻大 | 李弘謙 | 碩士 | 091 | Genes Identification and Search in Different Phase of DNA Sequence(DNA序列的不同相位上辨識與搜尋基因) | 畢業論文 |
| 邱繼廣 | 紀國鐘 | 碩士 | 091 | AlN capping layer for ion implantation(氮化鋁保護層應用於離子佈植活化之研究) | 畢業論文 |
| 許大願 | 陳培亮 | 碩士 | 091 | behavior of falling paper(紙片落下之行為研究) | 畢業論文 |
