| 學生 | 指導老師 | 碩/博士 | 學年度 | 論文題目 | 備註 |
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| 周祐陞 | 黎璧賢 | 碩士 | 095 | Numerical Simulations of Bursting Activities in Neuronal System(驟放式發火神經元的數值模擬) | 畢業論文 |
| 陳美廷 | 薛雅薇 | 碩士 | 095 | The Physical Properties of POPC/cholesterol Membranes: A Deuterium NMR Study(運用氘核磁共振儀研究POPC/cholesterol膜之物理性質) | 畢業論文 |
| 劉建良 | 聶斯特 | 碩士 | 095 | On quasi-local energy and the choice of reference(準局部能量與參考系之選擇) | 畢業論文 |
| 林裕翔 | 李文献 | 碩士 | 095 | The oxygen vacancy and spin polarization of cuprous oxide nanoparticle(奈米氧化亞銅微粒的氧化缺陷及自旋極化) | 畢業論文 |
| 徐殊凡 | 陳志強 | 碩士 | 095 | An experimental study of the motility of slime mold(黏菌之運動模型研究) | 畢業論文 |
| 陳岱沂 | 陳志強 | 碩士 | 095 | Nonlinear Stochastic Effect of Ion Channels on Current Fluctuations(離子通道電流漲落的非線性行為) | 畢業論文 |
| 廖振廷 | 伊林 | 碩士 | 095 | Microscopic Particle Dynamics in Dust Acoustic Waves and Dusty Plasma Bubbles(微粒聲波與微粒電漿微泡之粒子動力學) | 畢業論文 |
| 蘇致瑋 | 李弘謙 | 碩士 | 095 | A Denoising Method based on the Hilbert-Huang Transform and an application to Current Source Identification from EEG Data(以希爾伯-黃轉換為基礎的去噪音方法以及從腦電儀資料辨識電流源的應用) | 畢業論文 |
| 林政達 | 陳方玉 | 碩士 | 095 | Abnomal heat release of melittin binding to saturated lipid membrane(蜂毒蛋白吸附飽和鏈脂膜的異常放熱) | 畢業論文 |
| 陳夙容 | 陳方玉 | 碩士 | 095 | Leakage of lipid vesicle studied by dye fluorescence method(以螢光染料方法研究脂質微胞的滲漏) | 畢業論文 |
